前列腺癌：大数据可释放80个新的药物靶点
时间：2018-04-18 05:25:27 （次浏览 ）
在对前列腺癌遗传学进行分析的最大研究中，科学家发现不少于80个新的潜在药物靶点。该项目为新疗法的设计开辟了广阔的途径。
提取基因数据曾经是一项繁琐且耗时的任务。
但是，随着技术的不断完善，这项工作变得更快更便宜。
同时，可用于处理大型数据集的工具已大大改善。
综合起来，这意味着从遗传密码收集到的海洋信息可以进行分析，绘图和相对简单的组合，以提供更高层次的清晰度。
最近，一个国际团队使用这种DNA分析和大数据双管齐下的方法研究前列腺癌的遗传学。这项研究是在英国伦敦癌症研究所（Institute of Cancer Research）策划的。
前列腺癌的挑战
前列腺癌是美国男性中第二大常见癌症。今年在美国，估计将有164,690例前列腺癌新病例和近3万人死于该疾病。
尽管研究人员在理解和治疗前列腺癌方面取得了进展，但仍然有许多困难。
正如研究负责人Rosalind Eeles教授所解释的那样，“我们在癌症研究中面临的挑战之一是疾病的复杂性以及我们可能治疗它的众多方法。”
英国癌症研究所的Justine Alford博士概述了研究和干预前列腺癌的另一个问题。
“解决前列腺癌问题取得进一步进展的主要障碍，”她解释说，“缺乏准确预测人类疾病进展的方法，因此很难确定哪种治疗方法对每位患者都是最佳的。”
收集基因数据
为了从一个新的方向来解决这个问题，研究人员从112位前列腺癌男性获得遗传信息，并将其与一系列其他研究的数据结合起来。总之，使用来自930名患者的样品。
利用最新的大数据技术，该团队获得了引发发展并推动前列腺癌进展的基因变化的新见解。一旦他们了解涉及哪些基因，他们可以创建这些基因编码的蛋白质图谱。
接下来，他们转向一个名为canSAR的数据库，该数据库结合了来自研究的数据，应用机器学习，并有助于提供药物发现的见解。
CanSAR在他们的网站上解释了他们的数据库想要回答的问题：“蛋白质是什么，它表达或者突变的癌症，以及用什么化学工具和细胞系模型来实验性地探测它的活性？是否知道一种药物，细胞的敏感性特征以及已知哪些蛋白结合，这可能解释了不寻常的生物活性？“
科学家们发现他们发现的80种蛋白质是潜在的药物靶点。其中11种是现有药物的靶向药物，另外7种药物可能已经成为临床试验药物的靶标。
他们的研究结果本周在Nature Genetics杂志上发表。
“我们的研究在大数据分析中应用尖端技术来解开大量有关前列腺癌的新信息以及与疾病作斗争的可能方法。”
Rosalind Eeles教授
展望未来
当然，这些发现需要进一步研究才能临床使用，但它们提供了一系列新的可能性。
作为共同作者Paul Workman教授解释说：“本研究发现了大量推动前列腺癌发展的新基因，并为我们提供了关于如何利用该疾病的生物学发现潜在的新治疗方法的重要信息。 “
他希望他们的工作能够“刺激他们已经确定的遗传变化和潜在药物靶点的新一轮研究浪潮，目的是让患者尽快受益。”
前列腺癌治疗设计的另一个绊脚石是疾病在每个个体中进展不同的方式。这使得确定哪种治疗方案最适合于每位患者更加困难。
Alford博士希望：“通过大大增强我们对该疾病遗传学的理解，未来这一知识可以帮助医生更好地调整治疗个体的癌症，并希望看到更多的人能够幸存下来疾病。”
这些是早期的，但是来自下一代研究的发现可能会转化为现场。
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